Identifiants et méta-données

L’attribution d’identifiants pérennes à l’herbier a constitué l’un des buts de notre démarche (voir Agosti et al. 2022). Ainsi, L’herbier DP a été enregistré en 2010 dans l’« Interface de gestion des collections en ligne ; COEL », proposée par Tela Botanica.

En février 2019, suite à des échanges avec Marc Pignal (Muséum national d’Histoire naturelle), l’acronyme « DP » a été réservé dans l’Index Herbariorum.

L’import automatique par le GBIF des métadonnées contenues dans l’Index Herbariorum a déclenché l’attribution d’un identifiant GBIF à l’herbier DP.

La procédure de validation des planches mises en place fin 2019 a permis d’associer aux taxons représentés dans l’herbier DP l’identifiant fourni par l’INPN (référentiel TaxRef, identifiant CD_Nom).

Enfin, la conversion des données de l’herbier au format Darwin Core a eu lieu en fin de projet, et permettra d’intégrer les planches et les métadonnées au site Récolnat.

Identifiants de l’article

DOI de l’article (version sur abonnement) :
https://doi.org/10.5252/adansonia2023v45a13

Permaliens (version open access) :
http://adansonia.com/45/13
https://sciencepress.mnhn.fr/en/periodiques/adansonia/45/13

Catalogue complet des planches de l’herbier de Daniel Pellé :
https://doi.org/10.5852/adansonia2023v45a13_s3
https://sciencepress.mnhn.fr/sites/default/files/documents/en/adansonia2023v45a13_s3.pdf

Identifiants attribués au jeu de données complet

Index Herbariorum (acronyme « DP ») :
http://sweetgum.nybg.org/science/ih/herbarium-details/?irn=255270

Collections en Ligne (Tela Botanica), ID « 1405 » :
urn:lsid:tela-botanica.org:coel:col1405

DOI du jeu de données sur Zenodo (no. 4443430) :
https://doi.org/10.5281/zenodo.4443430

Identifiant “GrSciColl” (Global Registry of Scientific Collections) attribué par le GBIF :
https://www.gbif.org/grscicoll/collection/e5f999e3-6104-402d-b575-8caecd4d4fcf

Identifiant de la version archivée de l’article sur Zenodo :
https://zenodo.org/records/8056158

Sites de référence utilisés et identifiants associés aux spécimens de l’herbier DP

Tela Botanica, identifiant « bdtfx » (flore de France) :
http://referentiels.tela-botanica.org/referentiel/index.php?module=Consultation&ref=bdtfx

Tela Botanica, identifiant « isfan » (flore d’Afrique du Nord).

Institut national du Patrimoine naturel (INPN), identifiant « CD_NOM » du référentiel « TAX_REF » (territoires français) :
https://inpn.mnhn.fr/

Identifiants attribués suite à la publication de l’article

La publication de l’article dans la revue Adansonia du Muséum a permis aux données de l’herbier de Daniel Pellé d’être extraites par l’organisme Plazi (http://plazi.org/) et versées dans les bases de la recherche. Elles se sont vues ainsi attribuer une série d’identifiants pérennes (qui permettent à ces données d’être facilement trouvables et citables dans d’autres publications). Voici ces identifiants :

LSID de l’article : urn:lsid:plazi.org:pub:FF91FFB5646BFF9769629541875E2768

Enfin, chacune des planches de l’herbier DP est accessible en haute-définition via une URL de type :
https://zenodo.org/record/4443430/files/[numéro de planche].jpg (sans les crochets)
ex. :
https://zenodo.org/record/4443430/files/DP0001.jpg

Métadonnées de l’herbier

Données complète de l’herbier DP Export du 28 mars 2021 :
Données complètes validées (format Excel).


🔗 Bibliographie